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多组学数据挖掘策略在揭示水熊虫极端环境耐受机制方面具有巨大潜力。通过整合基因组学、转录组学和蛋白质组学,研究团队破译了河南高生熊虫抗辐射反应的基因组全景图。在差异分析和筛选关键分子后,研究团队使用生化和细胞方法来验证它们的功能作用,并深入研究潜在分子机制。
具体来说,研究团队首先获取了新鉴定的辐射耐受性物种河南高生熊虫的染色体水平高质量基因组图谱,基因组大小为112。6M,注释得到个编码蛋白基因,均匀分布于6条染色体。
通过重离子辐射后的转录组和蛋白质组差异分析,研究团队从中鉴定出2801个差异表达基因(DEG)。基于这些差异表达基因的进化和功能分析,研究团队描述了其三类辐射耐受机制:
第一类,水平基因转移(HGT)可能是水熊虫发展超高辐射抗性的重要进化事件。该研究鉴定了DOPA双加氧酶基因DODA1,这是一种从细菌到缓步动物的水平基因转移的产物。DODA1通过催化生物合成一种主要存在于植物、少数真菌和细菌中的色素——甜菜素来抵抗辐射。
第二类,水熊虫特异性的辐射诱导的无序蛋白TRID1通过介导液-液相分离(LLPS)过程,加速了DNA损伤修复。
第三类,非水熊虫特异性基因也有助于其辐射耐受,该研究发现,两个线粒体呼吸链复合体组装蛋白BCS1和NDUFB8显着上调,然后积累以加速NAD+再生,以实现PARylation修饰和随后的PARP1介导的DNA损伤修复。
借此三类机制,我国学者揭开水熊体内那超强抗辐射能力的分子机制。
而另外一份报告,上面所描述的是另外一种地球上古老的生物:涡虫。
涡虫,是三肠目涡虫科真涡虫属扁形动物。涡虫身体柔软扁平,两侧对称,体有背、腹和前后之分;背面稍凸,多黑褐色,腹面色浅,前端呈三角形,两侧各有一耳突,头部背面有两个黑色眼点,无肛门;身体腹面密生纤毛,依靠纤毛和肌肉的运动能使涡虫在物体上作游泳状爬行。因其摆动时激水呈涡状,故名涡虫。
涡虫分布于中国林县、嵩县、信阳等地,喜栖息在阴凉淡水溪流中,常隐蔽在水底的石块或树叶下。涡虫为食肉性动物,以小型水生动物为食,也食蠕虫、小甲虫类、环虫和螺类及昆虫幼虫。涡虫可无性和有性生殖,有性生殖仅在早春到晚夏进行,经2-3周即发育为幼体。
涡虫作为古老物种之一,生命历程已经超过5。2亿年。涡虫还是生物教学中常用的动物实验材料之一,其有着惊人的组织修复能力,生物学家将它们切成两段后,两边可再生出新的肌肉、皮肤、肠道,甚至完整的大脑,而且这种再生能无限地进行下去。涡虫无限再生寿命机制,为研究人类细胞、克服老化、延缓衰老特征带来新的希望。而前不久,经过以白泽为代表的研究团,直接揭开了其无限再生的寿命机制。
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